我们把药物按正常用法和剂量使用时，产生的与用药目的无关或对机体有害的反应叫药物的不良反应。抗生素的不良反应主要有毒性反应、过敏反应、二重感染和细菌产生耐药性。表现症状几乎覆盖了人体所有器官和系统，许多口服抗生素会造成轻到中度恶心、腹部不适;还有的可引起严重的肝、肾损害;在血液系统可引起再生障碍性贫血等;耳毒性导致听力损害;导致体内菌群失调继发霉菌感染;严重的过敏反应可以危及生命。

比如口服青霉素是临床最常用的药物，如阿莫西林、阿莫仙、青霉素V钾片等。那么口服青霉素是否要作皮试。在几年以前，有些口服青霉素制剂的说明书曾经有过“服用前免皮试”的字样，这是极其错误和危险的。国家药品监督管理局于1999年6月发布文件明确指出，今后口服青霉素制剂的包装、标签、说明书以及相关宣传资料上不得再出现免作皮试的字样，就是说口服各种青霉素制剂和注射青霉素一样，必须先作皮试。

因为，青霉素过敏反应与用药剂量大小、给药途径无关，对于高度敏感者来说，极微量的药物就可引起过敏性休克和死亡。据国内统计：死于青霉素过敏性休克的病人中约有1/4发生于皮试时。

国家药品不良反应监测中心专门负责监测药物的不良反应，在所有中西药物不良反应报告病例中抗生素占了总数的近一半，其数量和严重程度都排在各类药品之首。我国有近2000万听力障碍的残疾人中，一半左右是由于使用氨基糖苷类抗菌药物(如庆大霉素等)造成的，我国每年有19.2万人死于药品不良反应，其中抗生素造成的占2/3以上。