复方胃蛋白酶一般是不会出现副作用的。由于这是一种中成药制剂，相对来说副作用是比较小的，在临床上很少有患儿，在服用之后出现有不良反应。但过敏体质者在服用之后也可能会出现有皮肤过敏等情况。复方胃蛋白酶虽然属于中药制剂副作用非常小，但在服用的时候一定要严格按照剂量进行，最好是可以在医生的指导下服用。滥用药物或者是大剂量浮动，对于婴幼儿的身体健康都会是非常不利的。