小便疼痛的原因有很多，我们首选要考虑的就是是不是因为尿道炎，尿路感染引起的，一般来说是细菌等致病微生物逆行感染引起的和久坐，憋尿，饮食辛辣刺激，喝水太少，都有关系。个人建议前往正规医院的泌尿外科检查尿常规，尿培养明确致病微生物的种类和药物敏感性，选用合适敏感的抗生素持续治疗一周应该能好的。