肾结石的微创手术包括经皮肾镜手术和输尿管软镜手术。经皮肾镜检查需要皮肤穿刺建立进入肾脏收集系统的通道。手术最主要的风险是术中术后的出血、感染和结石残留等。静脉性出血一般保守治疗可以好转，动脉性出血可能需要介入治疗，甚至切除肾脏。如果出现尿源性脓毒血症将有一定的生命危险，最主要处理是抗感染、抗休克治疗。结石残留，可能需要二期手术或者体外冲击波碎石。输尿管软镜手术不需要穿刺，出血风险小，但仍然有感染和结石残留的风险。