巧克力囊肿如果发生破裂，对女性子宫危害甚大，进一步会影响生育能力，破裂可反复发生。破裂的后果有：破裂后陈旧性血液溢入腹腔引起剧烈腹痛、恶心、呕吐，甚至可以引起休克等，常须急诊处理；如果囊肿破裂时累及囊壁血管，可合并内出血；破裂后囊液溢到腹腔，加重盆腔子宫内膜异位症病情；反复破裂，增加了不孕症可能性；反复破裂易继发感染。