疱疹主要是由于病毒引起的，喉咙疱疹一般是呼吸道病毒感染导致的，肠道病毒引起的传染病,多发生于5岁以下的婴幼儿,可引起发热和手、足、口腔等部位的皮疹、溃疡,个别患者可引起心肌炎、肺水肿、无菌性脑膜脑炎等并发症。当出现疱疹性咽炎时多数孩子血液中白血球不升高或下降(细菌感染时白血球常常升高病毒感染白血球正常或降低)。疱疹性咽炎临床症状有发热、咽痛在口腔里、软腭上和扁桃腺、悬雍垂上出现小疱疹。