首先是遗传因素，强制性脊柱炎是一种具有高度遗传性的疾病。人类的白细胞抗原HLA-B27与强直性脊柱炎密切相关，研究证实HLA-B27直接参与了强直性脊柱炎的发病，是强直性脊柱炎的原发关联成分。HLA-B27在强直性脊柱炎患者中的阳性率约90%；强直性脊柱炎患者当中骨关节和滑膜组织中，有大量的炎性T细胞、单核巨噬细胞，存在T细胞应答和T细胞因子水平的平衡偏移。