由于用于检查的小肠套管价格昂贵，每根套管约7000元，而目前国内要求一次性使用，不能重复使用小肠套管，大大增加了小肠结肠镜检查的成本。结肠镜检查是一项比较复杂的检查，操作难度大，技术要求高，耗时长，一般检查后需要住院，住院总费用约为2万。仅结肠镜检查的费用就高达15000元，如果需要病理检查，则需要额外的活检钳和病理检查费用。