宝宝慢性腹泻的治疗方法有多种，首先需要使用对症治疗，其中包括预防脱水和平衡营养，出现脱水的情况就要补充液体。除此之外，还可以使用中医疗法，其中包括中医推拿和中药敷贴，在治疗的过程中需要做好护理工作，维持自身的营养，一旦出现不良反应，就要及时纠正。

出现慢性腹泻后可以吃磺胺类药物，该类药物有很好的止泻疗效，不过服药时最好遵听医嘱。如果腹泻情况比较严重，则可以应用吸附性止泻药。另外，因细菌、真菌引起的慢性腹泻，可服用抗生素来抑菌杀菌，达到治疗目的。而中药上可以服用人参健脾丸、六君子丸、附子理中丸等中成药来治疗慢性腹泻。

导致小儿发生慢性腹泻的原因主要是因为肠道菌群失衡，因为新生儿菌群尚未形成，如果在受到细菌、病菌和真菌等多种致病菌感染后，滥用抗生素的话，就容易引起慢性腹泻。另外，长期营养不良、乳糖不耐受和喂养不当的话，也容易造成小儿出现慢性腹泻的情况。

预防慢性腹泻的关键性措施之一为养成良好饮食习惯，不可以生食肉食，应避免进食刺激性较大的肥厚、油腻及生冷食物。同时要加强身体保暖，避免腹部受风受寒，平时则要积极参与体育锻炼，注意个人清洁卫生。除此之外，还要定期去医院做肠胃镜及大便常规一类检查。

当出现慢性腹泻时，西医上会建议用肠炎宁片等止泻药、枯草杆菌二联活菌肠溶胶囊等肠道微生态制剂止泻；必要时应用补液盐防止脱水。中医上可辨证服用胃苓汤加减、葛根岑连汤加减、痛泻要方加味等中药治疗；也可以选择推拿按摩的方法止泻。