尿道和阴茎结核的区别是部位不同，尿道结核主要是尿道口刺痛排尿异常的情况，阴茎结核主要是在阴茎上面，可能是通过性生活而进行传播的，一定要及时的进行治疗可能会影响以后的性功能，也会对排尿系统造成一些影响，可以服用一些抗感染的药物来促进病情恢复。