食管囊肿是处于中纵隔的一种囊腺肿物，是由于先天性胚胎在发育过程中出现了畸形，食管囊肿的发病率非常低。根据囊腔内层所覆盖的黏膜上皮不一样，如果覆有食管黏膜上皮被叫做食管囊肿，如果覆有胃黏膜上皮叫做胃囊肿，如果覆有肠粘膜上皮叫做肠囊肿，如果几种粘膜混合存在，叫做混合性肠源性囊肿。