自身免疫性肝炎的诊断标准是一系列临床、血清学和免疫学表现，表明自身免疫性肝炎并排除由其他原因引起的肝病。病人肝功能异常，通常谷丙转氨酶高于谷草转氨酶，血清胆红素水平中度升高，可见黄疸。腹部彩色多普勒超声显示肝脏回声不均匀，病毒学检查通常是阴性的。抗核抗体、抗微粒体抗体、抗平滑肌抗体和抗线粒体抗体免疫指标呈阳性。