慢性咽炎与慢性扁桃体炎的区别主要是引起的症状位置不一样。慢性咽炎一般情况下肢喉咙内有咽炎引起的一种疾病，慢性扁桃体炎一般是扁桃体发炎引起的一种疾病。当出现这两种疾病的时候要尽早的到医院做一个针对性的检查，配合医生使用这些消炎药物来进行治疗。