不会影响窗口期，艾滋病窗口期说的是从感染到发现的时间，平均2至3周，理论上阻断药物不会影响窗口期。但是，阻断药物可能会阻止失败，可能是病毒抵抗力所导致的。如果封闭药物使用不当，可能会失败。也可能是阻止药物的使用为时已晚，并且病毒已经形成了储库。短时间会阻断血液中HIV的复制，但一段时间后，储存库中的病毒可能会释放并开始复制。