怀孕六十天做B超看不到孕囊可能就是胚胎已经停止发育了，不过先不要着急处理，应该等一周左右去医院复查，如果还是没有看到孕囊，就可以确定是胎停育。其次，怀孕六十天做B超看不到孕囊有可能是宫外孕导致的，也可能是生化妊娠或者自然流产等因素导致，这也需要后续检查才可以确诊，在确诊后就应该在医生的指导下积极进行治疗，能保胎就尽量保胎，如不能保胎，应该及时终止妊娠。