昏睡病的根本原因是锥形寄生虫，它可以生活在大脑的血液，骨髓和液体脑脊髓区域，破坏人体的免疫系统。法国国家研究中心微生物细胞研究室主任Derek·Robinson教授指出，锥状寄生虫由带有鞭毛的囊性原代细胞组成，具有多种功能，并分布在锥状寄生虫的根腱上。锥虫通过鞭毛的蠕动来代谢养分并排出废物。囊性细胞是锥形寄生虫内吞和裂解的唯一场所。