两种药物不能说哪种比较好，只有哪种比较适合，蓝芩口服液主要是用于小肠实热，咽炎，急性咽炎等，主要是清热解毒，利咽消肿，用于急性咽炎，胃，肺实热症所导致的咽痛，咽干，咽部灼热这些症状，主要成分就是板蓝根，黄芩，栀子，黄柏，胖大海。而蒲地蓝口服液，主要是用于​扁桃体炎以及痈肿疔疖等，也可以用于腮腺炎，咽炎，有清热解毒，抗炎消肿的作用。