结肠炎可分为两种类型：一种是由炎症性肠病引起的，可表现为溃疡性结肠炎和克罗恩病。另一种是由炎性感染、病毒或细菌感染引起的急性胃肠炎。前者的治疗大多需要给予自身免疫性疾病的药物治疗，如柳氮磺胺吡啶、美沙拉秦和灌肠。灌肠的药物包括锡粉、利多卡因和地塞米松。因疾病大多是自身免疫性疾病，需要给予大量的激素，同时需要给药来调节胃肠功能。后者是炎症性感染的情况，需要加以改善，并给予抗炎和抗病毒治疗。