目前临床上对于卵巢巧克力囊肿术后的患者，可以选择皮下注射亮丙瑞林或者是戈舍瑞林，连续用药三到六个月的时间，可以使体内残留的子宫内膜移位的病灶坏死，从而降低它的复发甚至不复发。但是临床上如果有生育要求的女性，也可以在手术后三个月积极的备孕。如果怀孕了那么女性在怀孕期间是不来月经的，这样会引起残留的子宫内膜异位病灶可能会出现坏死消失。如果患有卵巢巧克力囊肿的患者，临床上主要表现为进行性加重的痛经，而且囊肿会导致盆腔内环境的改变会出现粘连甚至影响怀孕。所以一般建议存在巧克力囊肿的患者，一般发现后应该积极的给予治疗，可以采取腹腔镜微创手术的方式，这种方式对机体的损伤较小。

巧克力囊肿属于子宫内膜异位症的一种，子宫内膜异位症的典型症状是下腹部疼痛。痛经疼痛是内异症的主要症状，它的典型症状为继发性痛经进行性的加重，疼痛一般多位于下腹部、腰骶部以及盆腔正中，有时可以呈现放射至会阴、肛门以及大腿，常于月经来潮时出现并且持续整个月经期，疼痛的严重程度与病灶大小不一定成比例，年龄严重的卵巢巧克力内膜异位症人患者，甚至可以引起无法忍受的疼痛，而且内异症的患者不孕正的比例是比较高的。它引起不孕症的原因比较复杂，比如盆腔微循环的改变影响精子、卵子相结合，性交不适也是比较常常出现的症状。

在一般情况下，巧克力囊肿一般是不会自己消失的。因为巧克力囊肿属于卵巢子宫内膜异位症的一种表现，是异味的子宫内膜到了卵巢，从而引起巧克力囊肿。因为囊肿里边全是血液，而且它每次会随着月经周期会有周期性的出血发生，一般很难会自行吸收，所以临床上建议患有巧克力囊肿的女性，每半年做一次b超检查。如果巧克力囊肿持续的增大或者伴有腹痛、阴道不规则出血的现象，这种情况可以选择手术治疗；如果是有生育要求的女性巧克力囊肿不大，而且没有明显的不适症状，也可以暂时观察，不需要做手术的，因为做手术有可能会伤害到卵巢功能影响怀孕的。

巧克力囊肿术后，如果不用药，5年内有一半左右的累计复发率。复发主要因为发病的体质没有变。发生巧克力囊肿的女性，体内环境可能比较适合异位内膜的扎根生长。通俗来说，其体质容易长巧克力囊肿。即使做了手术，切除病灶，其体质还是改变不了的。只要卵巢还可以产生雌激素，子宫内膜异位症可能卷土重来，巧克力囊肿也同样如此。在做囊肿手术时，都是尽量清除掉能见到的病灶。即使是盆腔其他位置的内异灶也是如此。然而有些病灶隐藏的很深，和周围的正常组织无法区分开来。这些微小隐匿的病灶，是术后复发的又一大根源。复发最大的痛苦莫过于痛经、盆腔痛。鉴于巧克力囊肿手术之后的高复发率，建议术后使用地诺孕素或促性腺激素释放激素激动剂或联合短效避孕药长期管理，力争复发率下降到最低的水平。

巧克力囊肿的诱发原因，一般就是子宫内膜异位症引起。另外，卵巢浆液性囊腺瘤或黏性囊腺瘤也可诱发。为什么会得巧克力囊肿，首先得知道巧克力囊肿实际是长在卵巢上的一个囊肿，但囊内液是那种巧克力的颜色。一般来讲，巧克力囊肿常常是因为卵巢的子宫内膜异位症造成，正常的子宫内膜异位到了卵巢的表面，每个月月经出血时也出血，时间长了以后就会形成咖啡色的咖啡色样的囊肿。这个囊肿会伴随月经的周期越来越大，甚至最后会发生破裂。除卵巢的子宫内膜异位症以外，还有卵巢的浆液性囊腺瘤或者是黏性囊腺瘤，也可能伴随囊内出血会出现咖啡色的液体。把液体抽出来时发现也是巧克力颜色。这个时候到底是什么样的囊肿，还需要把剥离出来在显微镜下观察，才能知道到底是什么原因造成，然后才能够去对症的去处理。总而言之，为什么会得巧克力囊肿，要知道是什么原因造成，更多的是卵巢的子宫内膜异位症或者是浆液性、黏性囊腺瘤的囊内出血。但为什么会得，这个原因目前还不清楚，还需要广大的医务工作者再进行深入探讨才能找到具体的原因。