儿童良性癫痫自愈率有各种各样的说法，在临床上并不是所有的儿童良性癫痫都会自愈，何时治疗，怎么治疗取决于以下几点：
1、发作频率、时间长度和昼夜节律：患儿首次发作，暂时不必治疗，发作不频繁，比如1-2年才发作一次的可以先观察，如果频繁发作特别是强直阵挛发作、日间发作次数较夜间多，一般就需要到医院做相关检查，考虑应用抗癫痫药物。用药的选择听从癫痫专业医生的医嘱。
2、发作间期脑电图特点：发作间期脑电图明显感觉异常，则需要治疗，反之，可以先观察。患儿至少2-3年以上没有发作，且脑电图正常的情况下可以考虑减药直到停药，不能突然停药。需要根据患者的具体情况决定。
3、认知和行为功能障碍：造成患儿学习困难和行为问题的癫痫患儿，需要癫痫药物的早期积极干预。
4、患儿父母对癫痫复发和抗癫痫药物不良反应的态度。
儿童良性癫痫治疗应把握用药时机并合理选药，制定药物治疗方案时，应该优先考虑药物的安全性和耐受性。谨听医嘱，服药不随意减量、间断，患儿发作完全控制后的减停药需个体化考量，即便完全停药后也需继续随访至少两年以上。
此外，儿童良性癫痫患儿在饮食方面，除了避免巧克力、咖啡、浓茶、酒精、辛辣刺激食物摄入，其他食物均可正常摄入。