月经来的头两天流咖啡色的，可能与正常现象、气血两虚、宫寒、阴道炎、子宫肌瘤等原因有关，患者可以在医生的指导下对症治疗。若身体出现不适症状，建议及时就医。
1.正常现象：月经来潮前期，经血量会比较少，经血可能不会及时排出，通常属于正常现象，女性不必过于担心。
2.气血两虚：月经刚来时是咖啡色的，可能与气血两虚有关，可能伴有月经异常、腰酸、头晕等不适症状，建议患者在医生的指导下使用气血双补丸、归脾丸、十全大补丸等药物治疗。
3.宫寒：不良生活方式以及饮食习惯会导致寒气入体，引发宫寒，使月经呈咖啡色，建议患者遵医生指导使用金匮肾气丸、桂枝茯苓丸、田七痛经胶囊等药物治疗。
4.阴道炎：该疾病考虑是病原体感染引起的，可能会出现分泌物异常、瘙痒、灼痛、月经呈咖啡色等症状。一般建议患者遵医嘱使用甲硝唑栓、保妇康栓、克霉唑阴道片等药物治疗。
5.子宫肌瘤：该疾病是常见的子宫肿瘤，较大者可有痛经、月经颜色改变等症状，患者可以在医生指导下通过子宫肌瘤切除术、子宫切除术等方式治疗。
月经期间，患者需要注意保暖，若存在痛经的情况，建议女性使用热水泡脚，可有效缓解疼痛。