新生儿黄疸首先要做胆红素的检测，也就说是新生儿黄疸诊断的一个重要指标，可以抽血、查血清中胆红素，也可以经皮测胆红素，经皮测胆红素是一种无创的检测方法，但是这种方法受到检测的部位，以及皮肤的厚薄与肤色的影响，可能会误导黄疸的情况，可以作为一种筛查使用，确诊的话需要测血清中的胆红素；
第二，其他的检查。像红细胞、血红蛋白、网织红细胞、有核红细胞计数，在新生儿黄疸时候必须要做这些常规检查，这样有助于对新生儿溶血病的筛查，有新生儿溶血病的时候，红细胞计数和血红蛋白会降低，网织红细胞会增多；其次要查血型，包括父母的血型和新生儿的血型，因为常见的有ABO血型和RH血型不合的溶血，必要时候可以进一步做溶血实验、血清特异性抗体的测定；
第三要做一些红细胞脆性试验，怀疑黄疸由于溶血引起但又排除血型不合溶血病时候可以做本试验，如果红细胞脆性增高，考虑遗传性球形红细胞增多、自身免疫性溶血症等；如果脆性降低，多见于地中海贫血这些血红蛋白病；
还有可以做G-6PD酶的缺乏比如G-6PD酶的活性降低，这样是诊断G-6PD缺乏的一个依据；另外可以做血、尿、脑积液的培养，血清特异性的抗体，C反应蛋白以及血沉的检查；对于黄疸怀疑为感染所导致，应做血和尿的培养；如果有中枢神经系统感染；有化脓性脑膜炎需要做脑积液，进行脑积液的培养、血清特异性抗体、C反应蛋白及血沉检查；血常规、白细胞计数增高或者是降低，白细胞里面有中毒颗粒或者出现核左移，可以做肝功能检查，肝功能测定血总胆红素或者结合胆红素；肝酶、谷丙转氨酶、谷草转氨酶，还有碱性磷酸酶这些都需要进行检测。另外是影像学的检查，影像学的检查、超声、核磁，怀疑胆道系统疾病的时候像胆管的囊肿，胆管的扩张、胆石症、胆道闭锁、胆囊缺如这些，需要做超声或者是核磁的检查。
再一个要做听力和视功能电生理检查，也就是说视听诱发电位，可以评价听觉传导神经通路功能的状态，早期预测胆红素中毒所导致的脑损伤，有助于暂时性或者是亚临床胆红素神经中毒症的诊断。