肛瘘，一般来讲，普遍认为是肛周脓肿以后破溃，或者切开以后形成的一个后遗的一个疾患。所以认为，肛瘘都是因为肛周的感染，是感染性疾病的不同的分期。一般来讲，典型的肛瘘，都是有外口，有瘘管和肛瘘的内口这么几部分来组成。
这外口都在肛门的边上，肛门外边能看得到。外口的多少也不一样，比较简单的可能就一个外口，比较复杂的可能多个外口。瘘管多少也不一样，有的瘘管，它是一个管，有的瘘管，它是一根管，但是它是弯曲的管，但是，却不是一个直的管。但是，还有一些肛瘘，它有分叉，它的构造有主管，还有支管，还有一些更加复杂的情况。
例如，有的肛瘘可能会形成各种马蹄形，或者是螺旋形。内口它也有的一个，有的可能多个，有的位置低一些，还有一些内口的位置相对高。但是来讲一般情况下，内口都在肛隐窝的地方，位置不是特别高。如果特别高的这些肛瘘，它的内口形成往往都是因为外伤或者是肠道炎性疾病造成，比如有时候吃一些鱼、骨头、鸡骨头、鱼刺、或者还有一些枣核等，扎到肠壁上造成的这些情况下，内口的位置可能比较高。一般情况下，如果是从肛隐窝感染的这种，一般的化脓性肛瘘，它的内口基本上位置不会太高。