肛周脓肿一般来讲是不会发生癌变，但是有一些恶性肿瘤的表现类似于肛周脓肿的表现，这是要值得重视的一个情况，并不是所有的肛门周围所有的肿胀、红肿、疼痛的这种情况都是肛周脓肿。
在临床上确实见到有一些情况，比如也是肛门周围的肿块，肿胀、疼痛、压痛，也是看上去红肿，但不是肛周脓肿。在临床上有时候见到一些肛周的恶性肿瘤，包括横纹肌的肉瘤，或者是其他的肉瘤，看上去容易跟肛周脓肿混淆，甚至有些大的专家，也有这种误诊的情况。
所以，在临床有时候还见到肛周有一些粘液腺癌，表现跟肛周脓肿有时候很类似，但是它并不是因为肛周脓肿而变来，这是两个病，只不过表现上有类似的一些地方，都是肿、结块、疼痛。有时候老百姓可能分不太清楚，需要通过专科医生的检查，或者有时候可能还需要通过辅助检查。
很多情况下，B超可以看出，如果脓肿的话，它里边有脓，B超里边没有脓液，都是有比较丰富的血流信号，这可以考虑，它是一个实质性的病变。分辨不清时候可能还需要做组织活检，来最后确诊。
所以，在临床上不是说，所有的肛门周围的肿胀、疼痛都是肛周脓肿，所以，有时候还要警惕恶性肿瘤这样的问题的发生。