如果儿童患有小儿缺铁性贫血首先要补充铁剂。铁剂的种类有很多，一般口服钨剂铁盐是最简单、最经济、最有效方法，多采用是二价铁，口服铁剂剂量，要按元素铁每日4到6毫克每公斤，每天分三次，最常用的制剂为硫酸亚铁、富马酸（亚）铁，服药时候禁忌喝茶水，避免铁被鞣酸沉淀而不能被吸收，并且在两餐之间口服为宜，可以减少胃肠道的反应，又可增加吸收。
吃铁剂的同时可以口服维生素C，可以增加铁的吸收，牛奶、茶、咖啡以及抗酸药物与铁同时服用，均可影响铁的吸收。还要同时补充钙剂和锌，儿童单纯补钙、补铁或者补锌的效果不理想，因为在钙、镁、锌都缺乏的情况下，单独补哪一种元素，都达不到治疗目的。
补充钙、锌有助于贫血儿童改善智力，稳定情绪，促进贫血儿童智力和体力的恢复。一般尽量用口服药治疗，仅在很少数的情况下，才用注射铁剂，像肠道对铁的吸收不良，例如胃切除，或者说胃肠型结肠炎、阶段性结肠炎，胃切除术后，胃肠道功能紊乱及妊娠持续的呕吐等，口服铁剂虽经减量，而仍有严重的胃肠道反应，常用的铁注射剂有右旋糖酐铁剂、山梨醇枸橼酸铁剂。