尿道结石手术以后需要常规应用抗生素，防止感染，多饮水、清淡饮食。目前很少行尿道切开取石，除非合并尿道憩室的结石，处理尿道憩室需要开放手术，术后需要及时换药、留置尿管、保留尿管通畅，应用抗生素，防止感染。
尿道结石手术多为微创手术。尿道结石坎顿于尿道，尤其是尿道舟状窝，紧邻尿道口的位置，一般可以向尿道内注入润滑剂，缓慢的将尿道结石推出尿道外口。尿道舟状窝的结石也可以通过血管钳钳夹出来，术后可能会有血尿、感染等，应口服或者静点抗生素，多饮水，对于尿道损伤严重的，需要留置尿管，在尿道黏膜修复好后再拔出尿管。
后尿道结石一般通过尿道探子或膀胱尿道镜直视下，将尿道结石推出膀胱，用激光或其他的能量把结石击碎，这种方法一般对尿道损伤比较小。术后短期内留置尿管即可，如果没有明显尿道狭窄，可以一天、二天左右拔出尿管。但是需要警惕，这种尿道结石容易合并感染，尤其是在腔内手术操作后，细菌更容易入血，容易形成菌血症、脓毒症，甚至感染中毒性休克。