肺部的真菌感染一般叫条件致病菌感染，也就是说这些真菌，一直存在体内，当身体的免疫功能正常的时候，这些真菌虽然存在体内，但是它不会引起致病。像口腔当中就有很多的这个真菌存在，但是很少会出现发病的情况。肺部真菌感染最常出现的一个就是长期的应用免疫抑制剂或者长期的应用激素的时候，使自身的免疫功能的下降，导致一个真菌的大量繁殖，形成一个真菌感染。
另外一个就是应用广谱的抗生素，大量的应用的时候，使体内的一个细菌平衡状态被打破。常见的这些致病的细菌的被杀死了，但是像真菌这一类的细菌，它由于广谱抗生素，一般都对真金没有杀死的作用，因此真菌就可以得到一个广泛的繁殖，使得产生一个真菌感染的情况。因此肺部真菌感染的一般来说是不传染的，都是最常见的是一个一元性的二重感染，比较多见。