孕六周孕酮正常值在20ng/ml以上，如果小于20ng/ml考虑孕酮较低。孕六周常常要检查孕酮水平，如果孕酮低于20ng/ml，一般考虑孕酮较低。临床上常常诊断先兆流产，要给予补充孕激素治疗。当然孕6周时，除了检查孕酮，更重要的是要做B超检查，以鉴别宫内孕还是宫外孕。孕六周时绝大部分宫内孕，B超都可以明确提示，可以看到宫内孕囊以及卵黄囊。如果B超提示宫内孕，一般要定期产检，这时可以检查孕激素。如果孕激素较低，给予补充孕激素治疗，尤其是伴有阴道出血、腹痛等先兆流产表现者，要给予补充孕激素治疗。
但如果孕六周时，B超没有看到宫内孕囊，这时就要进一步检查血HCG，两者相结合判断宫外孕的可能。这时无论孕激素多少，一般是不给予孕激素补充治疗的，先要判断是否是宫外孕。如果血HCG超过2500~3000单位每升，宫内未见孕囊，考虑宫外孕，要给予宫外孕的特意处理。如果这时血HCG较低，要定期复查B超和血HCG。有时与孕囊着床较晚、排卵较晚相关。