目前临床上对于巧克力囊肿的治疗方案的选择，需要根据患者的年龄、囊肿的大小、患者存在的临床表现和患者主要的致病原因综合的来进行考虑的。如果对于有生育要求的女性巧克力囊肿不大，仅仅表现为单纯的巧克力囊肿腹腔内没有明显的病灶，可以使用药物来缓解痛经的症状，这种情况下可以采取保守治疗，让患者尽早的怀孕解决生育要求。因为怀孕后对于子宫内膜异位症也是一种治疗，而对于年龄偏大已经有孩子的女性囊肿已经侵犯了身体的其他部位，而且症状比较重时需要进行根治性的手术，必要时也可以进行子宫以及双侧卵巢的切除。对于单发的巧克力囊肿，囊肿直径大于五厘米也可以进行腹腔镜下的囊肿剥除术，术后可以给予GNRHA药物治疗。

卵巢巧克力囊肿这属于子宫内膜异位症的一种，是具有生长功能的子宫内膜腺体移位到了卵巢上，从而形成的卵巢巧克力囊肿，这种囊肿不是一定必须手术的。如果囊肿的直径小于五厘米，患者的临床表现不严重，可以考虑暂时的保守治疗，可以给予一定的药物来进行治疗比如说中成药物，但是需要在医生的指导下来进行，必要时也可以服用一些避孕药，这些都可以抑制子宫内膜异位症的活性，从而达到抑制囊肿生长的目的使囊肿缩小，所以对于小于五厘米的巧克力囊肿，一般是不用进行手术的。如果囊肿大于五厘米而且临床的痛经的症状比较严重，这时候可以考虑进行手术治疗。

巧克力囊肿术后，如果不用药，5年内有一半左右的累计复发率。复发主要因为发病的体质没有变。发生巧克力囊肿的女性，体内环境可能比较适合异位内膜的扎根生长。通俗来说，其体质容易长巧克力囊肿。即使做了手术，切除病灶，其体质还是改变不了的。只要卵巢还可以产生雌激素，子宫内膜异位症可能卷土重来，巧克力囊肿也同样如此。在做囊肿手术时，都是尽量清除掉能见到的病灶。即使是盆腔其他位置的内异灶也是如此。然而有些病灶隐藏的很深，和周围的正常组织无法区分开来。这些微小隐匿的病灶，是术后复发的又一大根源。复发最大的痛苦莫过于痛经、盆腔痛。鉴于巧克力囊肿手术之后的高复发率，建议术后使用地诺孕素或促性腺激素释放激素激动剂或联合短效避孕药长期管理，力争复发率下降到最低的水平。

巧克力囊肿又称卵巢子宫内膜异位囊肿，主要症状是痛经、不孕和盆腔包块。巧克力囊肿首先需要做一下盆腔彩超检查，超声检查是诊断巧克力囊肿和膀胱、直肠内异症的重要方法，可以确定巧克力囊肿的位置、大小和形状，囊肿呈圆形或者椭圆形，与周围组织粘连，特别是子宫粘连，囊壁厚而粗糙，囊内有细小的絮状光点。盆腔CT及磁共振对其有诊断价值，但费用昂贵，不作为首选的方法。此外，需要做一下血清CA125检查，巧克力囊肿CA125水平可能升高，重症患者更为明显，但变化范围很大。腹腔镜检查是目前国际公认的内异症的最佳方法，不仅可以用于诊断，还可以进行腹腔镜下手术治疗。巧克力囊肿如果大于4cm建议手术治疗，腹腔镜是首选的手术方式。具体的手术方法需要根据患者的年龄、有无生育要求等综合进行评估。

巧克力囊肿是由于子宫内膜异位到卵巢上造成。子宫内膜异位到卵巢上，每个月子宫内膜出血，卵巢异位的子宫内膜也出血，日积月累这些出的血，不能排出体外，在局部聚积然后形成了囊肿。开始是鲜红色的血液，时间久了，就会变成巧克力色，也是咖啡色。囊液可能比较稀薄，也可能比较浓稠，但总的来讲成分是血液合并了液体。最常见是卵巢的子宫内膜异位症，但有些卵巢的浆液性肿瘤或黏性肿瘤，囊内壁也合并了出去，污染了囊内的液体，时间长了后，也会成为巧克力颜色。如何去鉴别巧克力囊肿是什么原因造成，就需把囊肿完整的或囊壁给剥离出，在显微镜下才能看到成分是什么，才能知道到底是巧克力囊肿、子宫内膜异位症是浆液性囊肿是黏性囊肿等等卵巢的肿瘤。