鳃裂囊肿及瘘管做一个颈部及甲状腺B超，来判断肿物性质、范围；喉镜是必须的，用来探查有无与下咽部相通的内瘘口；颈部正侧位片可以用于对于颈部皮肤可见外瘘口的患儿，可经瘘口注入造影剂后拍片以观察瘘管/窦道走行；颈部增强核磁用来观察病灶形态、范围；甲功五项来判断甲状腺有无功能下降。