咖啡斑一般不进行手术，但在幼儿期，随着孩子的体表增长，咖啡斑也会成比例增长，通过手术去除。但是手术切除咖啡斑后，会产生疤痕影响外观，也会产生疼痛和瘙痒的症状，甚至影响患者的就业，临床上很少使用。此外手术切除后仍需进行瘢痕清除治疗，有些患者的疤痕处于不可逆状态，给患者带来多重麻烦。