皮下真菌病：感染皮肤、皮下组织，包括肌肉与结缔组织，平常不会经血液流向重要脏器播散。但有些感染能够由病灶向四面组织迟缓扩散皱褶，如足菌肿等。有了些则沿淋巴管分散，如孢子丝菌病、着色芽生菌病。体系性真菌病：除袭击皮肤与皮下组织外，还累及组织和器官，甚至导致播散性感染。包括念珠菌病、曲霉病、隐球菌病、接合菌病与马内菲青霉病等。