骶神经根囊肿手术费用取决于手术方法、地点、病情的严重性。效果最好的是全身麻醉显微镜下骶骨囊肿切除术和神经套重建术，总手术费用在2万元到4万元之间。但是，其他所谓的“微创”治疗方法，例如骶骨囊肿抽吸及骶骨囊肿注入胶水，在手术中成本比较低，但很可能引起术后神经根粘连等严重并发症，不建议这样做。