慢性腹泻会引发的并发症之一就是感染，除了一般的感染之外，还包括真菌感染，甚至是全身性的真菌病。再就是会出现营养不良以及维生素缺乏症，这也是慢性腹泻常见的并发症之一。除此以外，慢性腹泻的并发症还包括病毒性心肌炎以及中毒性肝炎。

临床上确诊慢性腹泻可以根据所出现的各种不良表现，如果发现有持续性腹泻及腹痛发烧等症状，就需要高度怀疑该病发生。同时需要借助于粪便常规检查和粪便细菌学培养检查来确定病情，且要接受消化道内镜和呼气试验方面的检查，必要时可做超声波和影像学检查项目。

慢性腹泻在中医上被分为多个证型，其中分为寒湿泄泻型、水饮留肠型、湿热泄泻型和瘀阻肠络型等等，建议可以服用平胃散、苓桂术甘汤合己椒苈黄丸加减、葛根芩连汤加减和少腹逐瘀汤加减等药方。这些药方对治疗慢性腹泻都有一定的效果，除此之外，还可以针灸天枢穴、足三里穴等部位，这样能够改善症状。

慢性腹泻患者可以进行实验室检查、影像学检查、黏膜活组织检查、大便常规检查、纤维肠镜检查、胃镜和小肠镜检查等等。通过这些检查方法，能够有效的判断慢性腹泻的严重程度以及病变部位，然后结合检查结果，制定最合理的治疗方案，其中纤维肠镜检查是最全面且最直接的一种检查方法。

如果小儿患有慢性腹泻，可根据病情适当服用肠炎宁片进行治疗；如果出现了食欲不振或者消化不良的现象，可以服用山楂麦曲颗粒。除此之外，小孩子患上了慢性腹泻之后，也可以口服藿香正气口服液、参苓白术散等药物来治疗。