卵巢巧克力囊肿属于子宫内膜异位症的一种是非常容易复发的，目前临床上治疗子宫内膜移位症的根本目的是缩减和去除病灶、减轻和控制疼痛、治疗和促进生育、预防和减少复发，那么她的治疗方法应该根据患者的年龄症状、病变部位、病变范围以及对生育的要求加以选则。目前临床上强调个体化的治疗，可以选择药物进行治疗，治疗的目的是抑制卵巢功能阻止内膜异位症的复发，这种治疗方式适用于有慢性盆腔痛、经期痛、疼痛症状比较明显，而且有生育要求，没有卵巢囊肿形成的患者对于较大的卵巢、子宫内膜异位囊肿，特别是卵巢内的囊肿的性质没有明确者，并应该采取手术治疗。

巧克力囊肿属于子宫内膜异位症的一种，子宫内膜异位症的典型症状是下腹部疼痛。痛经疼痛是内异症的主要症状，它的典型症状为继发性痛经进行性的加重，疼痛一般多位于下腹部、腰骶部以及盆腔正中，有时可以呈现放射至会阴、肛门以及大腿，常于月经来潮时出现并且持续整个月经期，疼痛的严重程度与病灶大小不一定成比例，年龄严重的卵巢巧克力内膜异位症人患者，甚至可以引起无法忍受的疼痛，而且内异症的患者不孕正的比例是比较高的。它引起不孕症的原因比较复杂，比如盆腔微循环的改变影响精子、卵子相结合，性交不适也是比较常常出现的症状。

对于巧克力囊肿的女性，如果这时囊肿比较小，痛经症状又不是特别严重，那可以通过药物来保守治疗，比如口服达拉唑，或者是孕三烯酮。还可以考虑直接在月经期间，服用非甾体类的抗炎药，来进行对症止痛治疗，比如常用的布洛芬缓释胶囊，或者是吲哚美辛。同时对于有生育要求的女性，在巧囊不是特别大时，可以考虑尽早备孕怀孕，因为在怀孕以后巧克力囊肿就会萎缩变小，甚至是可能自愈。但如果巧囊已经超过5厘米，这时保守治疗效果不佳，就只能够考虑行腹腔镜手术将其切除，术后需要肌注曲普瑞林来避免巧囊的复发。如果女性因为巧克力囊肿已经出现破裂，那这时就需要考虑行急诊开腹手术治疗。

巧克力囊肿手术治疗是首选。药物治疗主要达到卵巢抑制目的，或“假孕”和“假绝经”。目前常用药物是孕激素、内美通和促性腺激素释放激素激动剂等。促性腺激素释放激素激动剂作用机制是通过下调垂体促性腺激素分泌，抑制卵巢释放雌、孕激素，造成体内低雌激素状态，起到暂时性药物“去势”作用，使异位内膜萎缩达到治疗目的。研究证明促性腺激素释放激素激动剂有效且安全，主要副反应是低雌激素状态引起更年期症状，如潮热、出汗、阴道干涩、烦躁、抑郁及骨质丟失、关节痛等。为改善用药者症状，需同时补充少量雌激素，即“反向添加”治疗，目的改善低雌激素状态的同时，不促进内异症病灶复发。“反向添加”除可明显改善症状外，骨密度下降也会减少。对内异症引起疼痛治疗办法最多，但特效药不多，治疗效果不理想。可首选非甾体类消炎药，如布洛芬等。若没有生育要求，可放置曼月乐治疗。

囊肿是长在了卵巢上，常叫卵巢的巧克力，子宫内膜长在了卵巢上，每个月月经的时候卵巢上的子宫内膜会出血，日积月累就形成了囊肿，形成巧克力囊肿。巧克力囊肿常常提示囊肿的内囊内的液体，是陈旧性的出血造成的。很多原因导致巧克力囊肿的囊内出血，最常见的将近接近80%以上的是卵巢的子宫内膜异位症。随着每次月经出血囊肿会长大，长到一定程度以后它可能会出现破裂，是最常见的卵巢的巧克力囊肿是子宫内膜异位囊肿。还有比如卵巢的浆液性或黏性囊肿，也有可能会有囊内的出血，颜色也可能是咖啡色或者是巧克力色。一定要把囊壁剥离下来，在显微镜下去看才能知道到底是什么病，可能是子宫内膜异位症，也可能是一个卵巢的病理性的肿瘤。