尿道结石治疗要根据结石位置，采用不同治疗方法。没有尿道狭窄、尿道憩室等结石，较小结石直接通过憋尿、用力排尿的方式排出；较大结石，借助血管钳经取出，偏大的结石，用血管钳经夹碎结石后取出。前尿道结石，借助茎根部组织麻醉，用钩取或钳出结石，有困难者，输尿管镜下碎石取出结石；后尿道结石，借助膀胱镜、激光等方式碎掉结石，之后取出。
一、没有尿道狭窄、尿道憩室等原因时，小的尿道结石可让患者憋尿，憋足尿至膀胱达到最大容量后，让患者用力排尿，则可能将比较小的结石排出。对体积偏大结石，需要进一步手术处理。对尿道舟状窝结石，可向尿道内注入润滑剂，无菌液体石蜡，将结石缓慢推出尿道口，或用血管钳经尿道外口深入将结石夹住之后取出。若结石偏大，可用血管钳将结石夹碎，体积变小后更容易取出结石；
二、前尿道结石采用阴茎根部组织麻醉下，压迫结石近端尿道，阻止结石后退，注入无菌液体石蜡，轻轻向尿道远端推挤，钩取或钳出结石。取出有困难时，可选择输尿管镜下碎石，然后取出结石，处理时切忌粗暴，尽量不做尿道切开取石，以免出现尿道狭窄；
三、后尿道结石可用尿道探子将结石轻轻推入膀胱，通过膀胱镜，用激光等能量平台将结石碎掉。