开颅手术的死亡率，是因患者病情而有所差异的。一般来讲，对于患者生理功能状态比较良好，开颅手术比较微创的情况下，患者的死亡率实际上是非常低的，甚至可以低到千分之一，乃至更低的水平。
而对于一些极为重症的开颅手术，由于患者突发疾病的打击，处于一个相对应急的状态，有一些患者在术前已经发生了脑疝，甚至更加紧急的情况，同时合并生命体征不稳定，这种开颅手术是一种急救的状态，患者的总体死亡率就会明显增高。比如对于特重型的颅脑损伤，患者的死亡率甚至可以达到20%以上，是一种非常紧急的情况。
而对于一些出血量比较大的重症脑出血，脑动脉瘤破裂出血、动静脉畸形破裂出血，这些开颅手术，患者的死亡率也是相对比较高的。一方面，患者的病情比较危重，另一方面，患者由于突发疾病，在术前准备和化验检查等方面都受到一定的局限，患者的生理状况也没有调到很好的状态。